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as_data_frame {igraph}

R 文档

从数据帧创建 igraph 图，反之亦然

描述

此函数从一个或两个包含（符号）边列表和边/顶点属性的数据帧创建 igraph 图。

用法

as_data_frame(x, what = c("edges", "vertices", "both"))

graph_from_data_frame(d, directed = TRUE, vertices = NULL)

from_data_frame(...)

参数

x	一个 igraph 对象。
what	字符常量，用于返回关于顶点、边或两者信息。默认值为“edges”。
d	一个数据帧，在前两列中包含符号边列表。其他列被视为边属性。自 0.7 版本以来，此参数被强制转换为带有 as.data.frame 的数据帧。
有向	逻辑标量，指示是否创建有向图。
vertices	一个带有顶点元数据的数据帧，或者 NULL。请参见下面的详细信息。自 0.7 版本以来，如果不是 NULL，此参数将被强制转换为带有 as.data.frame 的数据帧。
...	传递给 graph_from_data_frame。

详细信息

graph_from_data_frame 从一个或两个数据帧创建 igraph 图。它有两种操作模式，具体取决于 vertices 参数是否为 NULL。

如果 vertices 为 NULL，则 d 的前两列用作符号边列表，其他列用作边属性。属性名称取自列的名称。

如果 vertices 不为 NULL，则它必须是一个提供顶点元数据的数据帧。假定 vertices 的第一列包含符号顶点名称，这将作为 ‘name’ 顶点属性添加到图形中。其他列将添加为其他顶点属性。如果 vertices 不为 NULL，则检查 d 中给出的符号边列表是否仅包含 vertices 中列出的顶点名称。

通常，数据帧从某些电子表格软件（如 Excel）导出，并通过 read.table、read.delim 或 read.csv 导入到 R 中。

数据帧中的所有边都包含在图中，这可能包括多个平行边和循环。

as_data_frame 将 igraph 图转换为一个或多个数据帧，具体取决于 what 参数。

如果 what 参数为 edges（默认值），则返回图的边以及边属性。这些边将位于前两列中，命名为 from 和 to。（这也表示有向图的边方向。）对于命名图，顶点名称将包含在这些列中，对于其他图，则包含数字顶点 ID。边属性将位于其他列中。不建议使用名为 from 或 to 的边属性，因为这样数据帧中命名的列将不是唯一的。这些边按其数字 ID 的顺序排列。

如果 what 参数为 vertices，则返回顶点属性。顶点按其数字顶点 ID 的顺序排列。

如果 what 参数为 both，则返回顶点和边数据，在一个带有命名条目 vertices 和 edges 的列表中。

值

graph_from_data_frame 的 igraph 图对象，以及 as.data.frame 的数据帧或命名为 edges 和 vertices 的两个数据帧的列表。

注意

对于 graph_from_data_frame，在创建图之前，‘d’ 的前两列中的 NA 元素被替换为字符串“NA”。这意味着所有 NA 将对应于单个顶点。

‘vertices’ 的第一列中的 NA 元素也被替换为字符串“NA”，但 ‘vertices’ 的其余部分不会被触及。换句话说，顶点名称（=第一列）不能为 NA，但其他顶点属性可以。

作者

Gabor Csardi csardi.gabor@gmail.com

参见

graph_from_literal 用于创建图的另一种方式，read.table 用于从文件中读取表。

示例

## A simple example with a couple of actors
## The typical case is that these tables are read in from files....
actors <- data.frame(name=c("Alice", "Bob", "Cecil", "David",
                            "Esmeralda"),
                     age=c(48,33,45,34,21),
                     gender=c("F","M","F","M","F"))
relations <- data.frame(from=c("Bob", "Cecil", "Cecil", "David",
                               "David", "Esmeralda"),
                        to=c("Alice", "Bob", "Alice", "Alice", "Bob", "Alice"),
                        same.dept=c(FALSE,FALSE,TRUE,FALSE,FALSE,TRUE),
                        friendship=c(4,5,5,2,1,1), advice=c(4,5,5,4,2,3))
g <- graph_from_data_frame(relations, directed=TRUE, vertices=actors)
print(g, e=TRUE, v=TRUE)

## The opposite operation
as_data_frame(g, what="vertices")
as_data_frame(g, what="edges")

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