R igraph 手册页

graph_from_incidence_matrix {igraph}

R 文档

从关联矩阵创建图

描述

graph_from_incidence_matrix 从关联矩阵创建一个二分 igraph 图。

用法

graph_from_incidence_matrix(
  incidence,
  directed = FALSE,
  mode = c("all", "out", "in", "total"),
  multiple = FALSE,
  weighted = NULL,
  add.names = NULL
)

from_incidence_matrix(...)

参数

incidence	输入的关联矩阵。它也可以是来自 Matrix 包的稀疏矩阵。
有向	逻辑标量，是否创建有向图。
模式	一个字符常量，定义有向图中边的方向，对于无向图则忽略。如果为 ‘out’，则边从第一类顶点（对应于关联矩阵中的行）到第二类顶点（关联矩阵中的列）。如果为 ‘in’，则使用相反的方向。如果为 ‘all’ 或 ‘total’，则创建互边。
multiple	逻辑标量，指定如何解释矩阵元素。请参阅下面的详细信息。
weighted	此参数指定是否从关联矩阵创建加权图。如果为 NULL，则创建一个未加权的图，并且使用 multiple 参数来确定图的边。如果它是一个字符常量，那么对于每个非零矩阵条目，都会创建一个边，并且该条目的值将添加为由 weighted 参数命名的边属性。如果为 TRUE，则创建一个加权图，并且边属性的名称将为 ‘weight’。
add.names	一个字符常量，NA 或 NULL。graph_from_incidence_matrix 可以将关联矩阵的行和列名称添加为顶点属性。如果此参数为 NULL（默认值）并且关联矩阵同时具有行名和列名，则会将这些名称添加为 ‘name’ 顶点属性。如果您想要一个不同的顶点属性，请提供属性名称作为字符串。如果此参数为 NA，则不会添加任何顶点属性（类型除外）。
...	传递给 graph_from_incidence_matrix。

详细信息

二分图在 igraph 中具有一个 ‘type’ 顶点属性，这是一个布尔值，第一类顶点为 FALSE，第二类顶点为 TRUE。

graph_from_incidence_matrix 可以以两种模式运行，具体取决于 multiple 参数。如果为 FALSE，则为关联矩阵中的每个非零元素创建一个边。如果 multiple 为 TRUE，则矩阵元素四舍五入到最接近的非负整数，以获得在一对顶点之间创建的边的数量。

值

一个二分 igraph 图。换句话说，一个具有顶点属性 type 的 igraph 图。

作者

Gabor Csardi csardi.gabor@gmail.com

参见

make_bipartite_graph 是创建二分图的另一种方法

示例

inc <- matrix(sample(0:1, 15, repl=TRUE), 3, 5)
colnames(inc) <- letters[1:5]
rownames(inc) <- LETTERS[1:3]
graph_from_incidence_matrix(inc)

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