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igraph_options {igraph}

R 文档

igraph 包的参数

描述

igraph 有一些参数，这些参数（通常）会影响许多函数的行为。 可以通过 igraph_options 为整个会话设置这些参数。

用法

igraph_options(...)

igraph_opt(x, default = NULL)

参数

...	可以只给出一个列表作为参数，也可以以 name=value 形式给出任意数量的参数，或者根本不给出参数。 有关说明，请参见 Value 和 Details 部分。
x	一个包含选项名称的字符串。
default	如果在选项列表中未设置指定的选项，则返回此值。 这有助于检索选项并检查是否已设置，如果未设置，则单独设置。

详细信息

通过调用 igraph_options 函数设置的参数值将在会话的剩余时间内保持有效，影响 igraph 包的其他函数的后续行为，前提是给定的参数与这些函数相关。

这提供了自定义 igraph 包的功能的可能性，例如通过在包 igraph 的加载钩子中插入对 igraph_options 的适当调用。

当前使用的参数（按字母顺序排列）

add.params

逻辑标量，是否将模型参数添加到各种图构造函数创建的图中。 默认情况下为 TRUE。

add.vertex.names

逻辑标量，是否将顶点名称添加到节点级别索引，例如度数、介数等。 默认情况下为 TRUE。

annotate.plot

逻辑标量，是否使用图的名称（name 图属性，如果存在）作为 main，以及顶点和边的数量作为 xlab 来注释 igraph 图。 默认为 FALSE。

dend.plot.type

通过 plot_dendrogram 绘制社区结构树状图时要使用的绘图函数

。 可能的值为 ‘auto’（默认值）、‘phylo’、‘hclust’ 和 ‘dendrogram’。 有关详细信息，请参见 plot_dendrogram。

edge.attr.comb

指定如果修改图，如何处理边属性。 默认值为 list(weight="sum", name="concat", "ignore")。 有关详细信息，请参见 attribute.combination。

print.edge.attributes

逻辑常量，打印图时是否打印边属性。 默认为 FALSE。

print.full

逻辑标量，print.igraph 是否应同时显示图结构，或者仅显示图的摘要。

print.graph.attributes

逻辑常量，打印图时是否打印图属性。 默认为 FALSE。

print.vertex.attributes

逻辑常量，打印图时是否打印顶点属性。 默认为 FALSE。

return.vs.es

返回一组或一系列顶点/边的函数是否应返回正式的顶点/边序列对象。 此选项在 igraph 版本 1.0.0 中引入，默认为 TRUE。 如果您的包需要旧的行为，您可以在包的 .onLoad 函数中将其设置为 FALSE，而不会影响其他包。

sparsematrices

是否对（稀疏）矩阵使用 Matrix 包。 如果用户使用较大的图，建议使用。

verbose

逻辑常量，igraph 函数是否应比最小程度多说话。 例如，如果 TRUE，则某些函数在计算时将使用进度条。 默认为 FALSE。

vertex.attr.comb

指定如果修改图，如何处理顶点属性。 默认值为 list(name="concat", "ignore")。 有关详细信息，请参见 attribute.combination。

值

igraph_options 返回一个列表，其中包含已更新参数的旧值（不可见）。 如果没有任何参数，则返回所有选项的值。

对于 igraph_opt，为选项 x 设置的当前值，如果该选项未设置，则为 NULL。

作者

Gabor Csardi csardi.gabor@gmail.com

参见

igraph_options 类似于 options，igraph_opt 类似于 getOption。

其他 igraph 选项： with_igraph_opt()

示例

oldval <- igraph_opt("verbose")
igraph_options(verbose = TRUE)
layout_with_kk(make_ring(10))
igraph_options(verbose = oldval)

oldval <- igraph_options(verbose = TRUE, sparsematrices = FALSE)
make_ring(10)[]
igraph_options(oldval)
igraph_opt("verbose")

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