如果您从 R 中使用 igraph，请使用此选项
| print.nexusDatasetInfo {igraph} | R 文档 |
Nexus 网络存储库是一个在线的网络数据集集合。这些函数可以用来查询它，并直接将数据作为 igraph 图下载。
## S3 method for class 'nexusDatasetInfo'
print(x, ...)
## S3 method for class 'nexusDatasetInfoList'
summary(object, ...)
## S3 method for class 'nexusDatasetInfoList'
print(x, ...)
nexus_list(
tags = NULL,
offset = 0,
limit = 10,
operator = c("or", "and"),
order = c("date", "name", "popularity"),
nexus.url = igraph_opt("nexus.url")
)
nexus_info(id, nexus.url = igraph_opt("nexus.url"))
nexus_get(
id,
offset = 0,
order = c("date", "name", "popularity"),
nexus.url = igraph_opt("nexus.url")
)
nexus_search(
q,
offset = 0,
limit = 10,
order = c("date", "name", "popularity"),
nexus.url = igraph_opt("nexus.url")
)
## S3 method for class 'nexusDatasetInfoList'
x[i]
x, object |
要打印的 |
... |
当前被忽略。 |
tags |
一个字符向量，要搜索的标签。如果不给定（或 |
offset |
一个偏移量，用于选择部分结果。结果从 |
limit |
要返回的最大结果数。 |
运算符 |
一个字符标量。如果为 ‘or’（默认值），则返回至少具有给定标签之一的所有数据集。如果为 ‘and’，则仅返回具有所有给定标签的数据集。 |
order |
结果的排序，可能的值有：‘date’，‘name’，‘popularity’。 |
nexus.url |
Nexus 服务器的 URL。除非您设置了自己的 Nexus 服务器，否则不要更改此默认值。 |
id |
要查询或下载的数据集的数字或字符 ID。除了数据集 ID 之外，还可以直接在此处提供一个 |
q |
Nexus 搜索字符串。请参阅下面的示例。 |
i |
索引。 |
Nexus 是一个在线网络存储库，带有一个 API，允许对其进行程序化查询，并允许程序化数据下载。
nexus_list 和 nexus_info 函数查询在线数据库。它们都返回 nexusDatasetInfo 对象。nexus_info 返回的信息比 nexus_list 更多。
nexus_search 搜索 Nexus，并返回一个数据集列表，作为 nexusDatasetInfo 对象。请参阅下面的搜索示例。
nexus_get 基于数字 ID 或 Nexus 搜索字符串从 Nexus 下载数据集。对于搜索字符串，仅下载第一个搜索命中，但也可以查看 offset 参数。（如果没有找到数据集，则该函数返回一个错误。）
nexus_list 返回的 nexusDatasetInfo 对象具有以下字段
数据集的数字 ID。
数据集的字符 ID。
字符标量，数据集的名称。
字符，图中顶点和边的数量。顶点和边用斜杠分隔，如果数据集包含多个网络，则用空格分隔。
字符向量，数据集的标签。有向图具有标签“directed”。无向图被标记为“undirected”。其他常见的标签有：“weighted”，“bipartite”，“social network”等。
数据集中网络的 ID 和名称。数字 ID 和字符 ID 用斜杠分隔，多个网络用空格分隔。
nexusDatasetInfo 对象返回的 nexus_info 具有以下附加字段
字符标量，例如“2011-01-09”，数据集添加到数据库的日期。
字符向量，数据集中可用的数据格式。各种格式用分号分隔。
字符标量，数据集的许可证。
字符标量，数据集许可证的 URL。在使用数据集之前，请务必咨询此内容。
字符标量，数据集的简短描述，通常是一句话。
字符标量，数据集的完整描述。
字符标量，描述数据集的论文。如果您在研究中使用该数据集，请引用这些论文，大多数数据集的许可证都要求这样做。
一个列表的列表，每个列表条目都是一个图、顶点或边属性，并具有以下条目
属性的类型，可以是“graph”、“vertex”或“edge”。
属性的数据类型，目前可以是“numeric”和“string”。
字符标量，属性的名称。
字符标量，属性的描述。
Nexus 查询的结果以简洁的格式打印到屏幕上，类似于 igraph 图的格式。数据集列表（通常是 nexus_list 和 nexus_search 的结果）如下所示
NEXUS 1-5/18 -- data set list [1] kaptail.4 39/109-223 #18 Kapferer tailor shop [2] condmatcollab2003 31163/120029 #17 Condensed matter collaborations+ [3] condmatcollab 16726/47594 #16 Condensed matter collaborations+ [4] powergrid 4941/6594 #15 Western US power grid [5] celegansneural 297/2359 #14 C. Elegans neural network
此处的每一行代表一个数据集，并给出了关于它们的以下信息：数据集的字符 ID（例如，kaptail 或 powergrid），数据集中图的顶点数和边数。对于具有多个图的数据集，此处给出间隔。然后是数据集的数字 ID，剩余空间用数据集的名称填充。
关于单个 Nexus 数据集的摘要信息打印为
NEXUS B--- 39 109-223 #18 kaptail -- Kapferer tailor shop + tags: directed; social network; undirected + nets: 1/KAPFTI2; 2/KAPFTS2; 3/KAPFTI1; 4/KAPFTS1
这与用于打印 igraph 图的标题非常相似，但也有一些差异。NEXUS 单词后面的四个字符给出了该图的最重要的属性：第一个是 “U” 表示无向图，“D” 表示有向图，如果数据集包含有向图和无向图，则为 “B”。第二个是 “N” 表示命名图。第三个字符是 “W” 表示加权图，第四个是 “B” 表示数据集包含二分图。然后打印顶点数和边数，对于具有多个图的数据集，给出最小值和最大值。然后是数字 ID 和数据集的字符串 ID。第一行的末尾包含数据集的名称。第二行列出数据集标签，第三行列出数据集中包含的网络。
详细的数据集信息以类似的方式打印，但它包含更多字段。
nexus_list 和 nexus_search 返回一个 nexusDatasetInfo 对象的列表。该列表还具有这些属性
查询返回的数据集数量。
查询找到的数据集总数。
查询的 offset 参数。
查询的 limit 参数。
nexus_info 返回单个 nexusDatasetInfo 对象。
nexus_get 返回一个 igraph 图对象，或者如果数据集包含多个网络，则返回一个图对象列表。
nexus_list(tag="weighted")
nexus_list(limit=3, order="name")
nexus_list(limit=3, order="name")[[1]]
nexus_info(2)
g <- nexus_get(2)
summary(g)
## Data sets related to 'US':
nexus_search("US")
## Search for data sets that have 'network' in their name:
nexus_search("name:network")
## Any word can match
nexus_search("blog or US or karate")