R igraph 手册页

如果您从 R 中使用 igraph,请使用此选项

A B C D E F G H I K L M N O P Q R S T U V W misc

igraph-package igraph 包

-- A --

add.edges 向图中添加边
add.vertex.shape 绘制 igraph 图时的各种顶点形状
add.vertices 向图中添加顶点
add_edges 向图中添加边
add_layout_ 向图添加布局
add_shape 绘制 igraph 图时的各种顶点形状
add_vertices 向图中添加顶点
adhesion 边连通性。
adjacent.triangles 在图中查找三角形
adjacent_vertices 图中多个顶点的相邻顶点
aging.ba.game 生成具有优先连接和老化功能的演化随机图
aging.barabasi.game 生成具有优先连接和老化功能的演化随机图
aging.prefatt.game 生成具有优先连接和老化功能的演化随机图
algorithm 处理网络社区检测结果的函数
all_shortest_paths 顶点之间的最短(有向或无向)路径
all_simple_paths 列出从一个源的所有简单路径
alpha.centrality 查找网络位置的 Bonacich alpha 中心性分数
alpha_centrality 查找网络位置的 Bonacich alpha 中心性分数
any_loop 在图中查找多个或循环边
any_multiple 在图中查找多个或循环边
are.connected 两个顶点是否相邻?
are_adjacent 两个顶点是否相邻?
arpack ARPACK 特征向量计算
arpack-options ARPACK 特征向量计算
arpack.unpack.complex ARPACK 特征向量计算
arpack_defaults ARPACK 特征向量计算
articulation.points 图的铰接点和桥
articulation_points 图的铰接点和桥
as.dendrogram.communities 处理网络社区检测结果的函数
as.directed 在有向图和无向图之间转换
as.hclust.communities 处理网络社区检测结果的函数
as.igraph 转换为 igraph
as.igraph.igraphHRG 转换为 igraph
as.matrix.igraph 将 igraph 对象转换为邻接矩阵或边列表矩阵
as.undirected 在有向图和无向图之间转换
asPhylo 处理网络社区检测结果的函数
asPhylo.communities 处理网络社区检测结果的函数
assortativity 分类系数
assortativity.degree 分类系数
assortativity.nominal 分类系数
assortativity_degree 分类系数
assortativity_nominal 分类系数
asymmetric.preference.game 基于特征的随机生成
asym_pref 基于特征的随机生成
as_adj 将图转换为邻接矩阵
as_adjacency_matrix 将图转换为邻接矩阵
as_adj_edge_list 邻接表
as_adj_list 邻接表
as_bipartite 二分图的简单两行布局
as_data_frame 从数据帧创建 igraph 图或反之
as_edgelist 将图转换为边列表
as_graphnel 将 igraph 图转换为 graph 包中的 graphNEL 对象
as_ids 将顶点或边序列转换为普通向量
as_ids.igraph.es 将顶点或边序列转换为普通向量
as_ids.igraph.vs 将顶点或边序列转换为普通向量
as_incidence_matrix 二分图的关联矩阵
as_long_data_frame 将图转换为长数据帧
as_membership 将数值向量声明为成员向量
as_phylo 处理网络社区检测结果的函数
as_phylo.communities 处理网络社区检测结果的函数
as_star 生成坐标以将图的顶点放置为星形
as_tree Reingold-Tilford 图布局算法
atlas 从图形图集创建图形
attribute.combination 当图形更改时,igraph 函数如何处理属性
attributes 列出图形属性的名称
authority.score Kleinberg 的权威中心性分数。
authority_score Kleinberg 的权威中心性分数。
autocurve.edges 绘制图形时的最佳边曲率
automorphisms 自同构的数量
automorphism_group 图的自同构群的生成集
average.path.length 顶点之间的最短(有向或无向)路径
average_local_efficiency 图的效率

-- B --

ba.game 使用优先连接生成随机图
barabasi.game 使用优先连接生成随机图
betweenness 顶点和边的介数中心性
betweenness.estimate 顶点和边的介数中心性
bfs 广度优先搜索
bibcoupling 共引用耦合
biconnected.components 双连通分量
biconnected_components 双连通分量
bipartite 二分随机图
bipartite.mapping 确定图是否为二分图
bipartite.projection 投影二分图
bipartite.projection.size 投影二分图
bipartite.random.game 二分随机图
bipartite_graph 创建二分图
bipartite_mapping 确定图是否为二分图
bipartite_projection 投影二分图
bipartite_projection_size 投影二分图
blockGraphs 计算内聚块
blocks 计算内聚块
bonpow 查找网络位置的 Bonacich 权力中心性分数
bridges 图的铰接点和桥

-- C --

c.igraph.es 连接边序列
c.igraph.vs 连接顶点序列
callaway.traits.game 基于不同顶点类型生成图
canonical.permutation 图的规范排列
canonical_permutation 图的规范排列
categorical_pal 类别的调色板
centralization 图的集中化
centralization.betweenness 根据顶点的介数中心化图形
centralization.betweenness.tmax 介数中心化的理论最大值
centralization.closeness 根据顶点的紧密度中心化图形
centralization.closeness.tmax 紧密度中心化的理论最大值
centralization.degree 根据顶点的度数中心化图形
centralization.degree.tmax 度数中心化的理论最大值
centralization.evcent 根据顶点的特征向量中心化图形
centralization.evcent.tmax 介数中心化的理论最大值
centralize 图的集中化
centralize.scores 图的集中化
centr_betw 根据顶点的介数中心化图形
centr_betw_tmax 介数中心化的理论最大值
centr_clo 根据顶点的紧密度中心化图形
centr_clo_tmax 紧密度中心化的理论最大值
centr_degree 根据顶点的度数中心化图形
centr_degree_tmax 度数中心化的理论最大值
centr_eigen 根据顶点的特征向量中心化图形
centr_eigen_tmax 介数中心化的理论最大值
chordal_ring 创建扩展的弦环图
cited.type.game 随机引用图
citing.cited.type.game 随机引用图
cit_cit_types 随机引用图
cit_types 随机引用图
clique.number 查找派系的函数,即图形中的完整子图
cliques 查找派系的函数,即图形中的完整子图
clique_num 查找派系的函数,即图形中的完整子图
clique_size_counts 查找派系的函数,即图形中的完整子图
closeness 顶点的紧密度中心性
closeness.estimate 顶点的紧密度中心性
cluster.distribution 图的连通分量
clusters 图的连通分量
cluster_edge_betweenness 基于边介数的社区结构检测
cluster_fast_greedy 通过模块化贪婪优化实现的社区结构
cluster_fluid_communities 基于交互流体的社区检测算法
cluster_infomap Infomap 社区查找
cluster_label_prop 基于传播标签查找社区
cluster_leading_eigen 基于社区矩阵的引导特征向量检测社区结构
cluster_leiden 使用 Traag、van Eck & Waltman 的 Leiden 算法查找图的社区结构。
cluster_louvain 通过模块化的多层优化查找社区结构
cluster_optimal 最佳社区结构
cluster_spinglass 基于统计力学在图中查找社区
cluster_walktrap 通过短随机游走实现的社区结构
cocitation 共引用耦合
code.length 处理网络社区检测结果的函数
code_len 处理网络社区检测结果的函数
cohesion 顶点连通性。
cohesion.cohesiveBlocks 计算内聚块
cohesion.igraph 顶点连通性。
cohesive.blocks 计算内聚块
cohesiveBlocks 计算内聚块
cohesive_blocks 计算内聚块
communities 处理网络社区检测结果的函数
compare 使用各种指标比较社区结构
compare.communities 使用各种指标比较社区结构
compare.membership 使用各种指标比较社区结构
complementer 图的补图
components 图的连通分量
component_distribution 图的连通分量
component_wise 按组件布局
compose 将两个图形组合为二元关系
connect 图顶点的邻域
connect.neighborhood 图顶点的邻域
consensus_tree 从多个分层随机图模型创建共识树
console igraph 控制台
constraint Burt 的约束
contract 将多个顶点收缩为一个
contract.vertices 将多个顶点收缩为一个
convex.hull 一组顶点的凸包
convex_hull 一组顶点的凸包
coreness 图的 K 核分解
count.multiple 在图中查找多个或循环边
count_components 图的连通分量
count_isomorphisms 计算两个图之间同构映射的数量
count_max_cliques 查找派系的函数,即图形中的完整子图
count_max_weighted_cliques 查找加权派系的函数,即图中的加权完整子图
count_motifs 图模体
count_multiple 在图中查找多个或循环边
count_subgraph_isomorphisms 计算图与另一个图的子图之间的同构映射
count_triangles 在图中查找三角形
create.communities 创建社区对象。
crossing 处理网络社区检测结果的函数
curve_multiple 绘制图形时的最佳边曲率
cutat 处理网络社区检测结果的函数
cut_at 处理网络社区检测结果的函数

-- D --

decompose 将图分解为分量
decompose.graph 将图分解为分量
degree 顶点的度和度分布
degree.distribution 顶点的度和度分布
degree.sequence.game 生成具有给定度序列的随机图
degree_distribution 顶点的度和度分布
degseq 生成具有给定度序列的随机图
delete.edges 从图中删除边
delete.vertices 从图中删除顶点
delete_edges 从图中删除边
delete_edge_attr 删除边属性
delete_graph_attr 删除图形属性
delete_vertex_attr 删除顶点属性
delete_vertices 从图中删除顶点
dendPlot 社区结构树状图
de_bruijn_graph 德布鲁因图
dfs 深度优先搜索
diameter 图的直径
difference 两个集合的差集
difference.igraph 图的差集
difference.igraph.es 边序列的差集
difference.igraph.vs 顶点序列的差集
dim_select 使用配置文件似然选择奇异值的维度。
directed_graph 从边列表或著名图创建 igraph 图
disjoint_union 图的非交并集
distances 顶点之间的最短(有向或无向)路径
distance_table 顶点之间的最短(有向或无向)路径
diverging_pal 发散调色板
diversity 图形多样性
DL 读取外来文件格式
dominator.tree 支配树
dominator_tree 支配树
dot-data “.data”和“.env”代词
dot-env “.data”和“.env”代词
dot_product 根据随机点积图模型生成随机图
drl_defaults DrL 图布局生成器
dyad.census 图的二元人口普查
dyad_census 图的二元人口普查

-- E --

E 图的边
E<- 查询或设置边序列中边的属性
each_edge 将图的边的端点重新连接到随机顶点
eccentricity 图中顶点的离心率
ecount 图形的大小(边数)
edge 用于添加和删除边的辅助函数
edge.attributes 查询图的边属性
edge.attributes<- 设置一个或多个边属性
edge.betweenness 顶点和边的介数中心性
edge.betweenness.community 基于边介数的社区结构检测
edge.betweenness.estimate 顶点和边的介数中心性
edge.connectivity 边连通性。
edge.disjoint.paths 边连通性。
用于添加和删除边的辅助函数
edge_attr 查询图的边属性
edge_attr<- 设置一个或多个边属性
edge_attr_names 列出边属性的名称
edge_betweenness 顶点和边的介数中心性
edge_connectivity 边连通性。
edge_density 图形密度
edge_disjoint_paths 边连通性。
ego 图顶点的邻域
ego_graph 图顶点的邻域
ego_size 图顶点的邻域
eigen_centrality 查找网络位置的特征向量中心性分数
embed_adjacency_matrix 邻接矩阵的谱嵌入
embed_laplacian_matrix 图形拉普拉斯的谱嵌入
empty_graph 没有边的图
ends 一些图边的入射顶点
erdos.renyi.game 根据 Erdos-Renyi 模型生成随机图
establishment.game 基于不同顶点类型生成图
estimate_betweenness 顶点和边的介数中心性
estimate_closeness 顶点的紧密度中心性
estimate_edge_betweenness 顶点和边的介数中心性
eulerian_cycle 在图中查找欧拉路径或环
eulerian_path 在图中查找欧拉路径或环
evcent 查找网络位置的特征向量中心性分数
exportPajek 计算内聚块
export_pajek 计算内聚块

-- F --

farthest.nodes 图的直径
farthest_vertices 图的直径
fastgreedy.community 通过模块化贪婪优化实现的社区结构
feedback_arc_set 在图中查找反馈弧集
fit_hrg 拟合分层随机图模型
fit_power_law 将幂律分布函数拟合到离散数据
forest.fire.game 森林火灾网络模型
from_adjacency 从邻接矩阵创建图形
from_data_frame 从数据帧创建 igraph 图或反之
from_edgelist 从边列表矩阵创建图形
from_incidence_matrix 从关联矩阵创建图形
from_literal 通过简单界面创建(小型)图形
from_prufer 从 Prufer 序列创建无向树图
full_bipartite_graph 创建完整的二分图
full_citation_graph 创建完整的(完整)引用图
full_graph 创建完整图形

-- G --

get.adjacency 将图转换为邻接矩阵
get.adjedgelist 邻接表
get.adjlist 邻接表
get.all.shortest.paths 顶点之间的最短(有向或无向)路径
get.data.frame 从数据帧创建 igraph 图或反之
get.diameter 图的直径
get.edge 一些图边的入射顶点
get.edge.attribute 查询图的边属性
get.edge.ids 根据边的入射顶点查找边 ID
get.edgelist 将图转换为边列表
get.edges 一些图边的入射顶点
get.graph.attribute 图的图形属性
get.incidence 二分图的关联矩阵
get.shortest.paths 顶点之间的最短(有向或无向)路径
get.stochastic 图的随机矩阵
get.vertex.attribute 查询图的顶点属性
getIgraphOpt igraph 包的参数
get_diameter 图的直径
girth 图的围长
global_efficiency 图的效率
GML 读取外来文件格式
gnm 根据 G(n,m) Erdos-Renyi 模型生成随机图
gnp 根据 G(n,p) Erdos-Renyi 模型生成随机图
gorder 图的阶数(顶点数)
从边列表或著名图创建 igraph 图
graph.adhesion 边连通性。
graph.adjacency 从邻接矩阵创建图形
graph.adjlist 从邻接表创建图形
graph.atlas 从图形图集创建图形
graph.attributes 图的图形属性
graph.attributes<- 设置所有或一些图形属性
graph.automorphisms 自同构的数量
graph.bfs 广度优先搜索
graph.bipartite 创建二分图
graph.cohesion 顶点连通性。
graph.complementer 图的补图
graph.compose 将两个图形组合为二元关系
graph.coreness 图的 K 核分解
graph.count.isomorphisms.vf2 计算两个图之间同构映射的数量
graph.count.subisomorphisms.vf2 计算图与另一个图的子图之间的同构映射
graph.data.frame 从数据帧创建 igraph 图或反之
graph.de.bruijn 德布鲁因图
graph.density 图形密度
graph.dfs 深度优先搜索
graph.difference 图的差集
graph.disjoint.union 图的非交并集
graph.diversity 图形多样性
graph.edgelist 从边列表矩阵创建图形
graph.eigen 图形邻接矩阵的特征值和特征向量
graph.empty 没有边的图
graph.extended.chordal.ring 创建扩展的弦环图
graph.famous 从边列表或著名图创建 igraph 图
graph.formula 通过简单界面创建(小型)图形
graph.full 创建完整图形
graph.full.bipartite 创建完整的二分图
graph.full.citation 创建完整的(完整)引用图
graph.get.isomorphisms.vf2 计算两个图形顶点之间的所有同构映射
graph.get.subisomorphisms.vf2 图形与另一个图形子图之间的所有同构映射
graph.graphdb 从图形数据库加载图形以测试图形同构。
graph.incidence 从关联矩阵创建图形
graph.intersection 图形的交集
graph.isoclass 图形的同构类
graph.isoclass.subgraph 图形的同构类
graph.isocreate 从同构类创建图形
graph.isomorphic 确定两个图形是否同构
graph.isomorphic.34 确定两个图形是否同构
graph.isomorphic.bliss 确定两个图形是否同构
graph.isomorphic.vf2 确定两个图形是否同构
graph.kautz Kautz 图
graph.knn 平均最近邻居度
graph.laplacian 图形拉普拉斯算子
graph.lattice 创建网格图
graph.lcf 从 LCF 表示法创建图形
graph.maxflow 图中的最大流量
graph.mincut 图中的最小割
graph.motifs 图模体
graph.motifs.est 图模体
graph.motifs.no 图模体
graph.neighborhood 图顶点的邻域
graph.ring 创建环图
graph.star 创建星图,即具有 n 个顶点和 n - 1 个叶子的树
graph.strength 强度或加权顶点度
graph.subisomorphic.lad 确定图形是否与另一个图形子图同构
graph.subisomorphic.vf2 确定图形是否与另一个图形子图同构
graph.tree 创建树图
graph.union 图形的并集
graphlets 图形的图元分解
graphlets.candidate.basis 图形的图元分解
graphlets.project 图形的图元分解
graphlet_basis 图形的图元分解
graphlet_proj 图形的图元分解
GraphML 读取外来文件格式
graphs_from_cohesive_blocks 计算内聚块
graph_ 将对象转换为图形
graph_attr 图的图形属性
graph_attr<- 设置所有或一些图形属性
graph_attr_names 列出图形属性的名称
graph_from_adjacency_matrix 从邻接矩阵创建图形
graph_from_adj_list 从邻接表创建图形
graph_from_atlas 从图形图集创建图形
graph_from_data_frame 从数据帧创建 igraph 图或反之
graph_from_edgelist 从边列表矩阵创建图形
graph_from_graphdb 从图形数据库加载图形以测试图形同构。
graph_from_graphnel 将 graph 包中的 graphNEL 对象转换为 igraph
graph_from_incidence_matrix 从关联矩阵创建图形
graph_from_isomorphism_class 从同构类创建图形
graph_from_lcf 从 LCF 表示法创建图形
graph_from_literal 通过简单界面创建(小型)图形
graph_id 获取图形的 ID
graph_version igraph 数据结构版本
greedy_vertex_coloring 贪婪顶点着色
grg 几何随机图
grg.game 几何随机图
groups 顶点分区的组
groups.communities 顶点分区的组
groups.default 顶点分区的组
growing 增长随机图生成
growing.random.game 增长随机图生成
gsize 图形的大小(边数)

-- H --

harmonic_centrality 顶点的调和中心性
has.multiple 在图中查找多个或循环边
has_eulerian_cycle 在图中查找欧拉路径或环
has_eulerian_path 在图中查找欧拉路径或环
head_of 图中边的头部
head_print 仅打印 R 对象的头部
hierarchical_sbm 采样分层随机块模型
hierarchy 计算内聚块
hrg 从 igraph 图创建分层随机图
hrg-methods 分层随机图
hrg.consensus 从多个分层随机图模型创建共识树
hrg.create 从 igraph 图创建分层随机图
hrg.dendrogram HRG 树状图
hrg.fit 拟合分层随机图模型
hrg.game 从分层随机图模型采样
hrg.predict 基于分层随机图模型预测边
hrg_tree 从分层随机图模型创建 igraph 图
hub.score Kleinberg 的枢纽中心性分数。
hub_score Kleinberg 的枢纽中心性分数。

-- I --

identical_graphs 确定两个图形是否相同
igraph igraph 包
igraph-attribute-combination 当图形更改时,igraph 函数如何处理属性
igraph-dollar 获取和设置图形属性,快捷方式
igraph-es-attributes 查询或设置边序列中边的属性
igraph-es-indexing 索引边序列
igraph-es-indexing2 选择边并显示其元数据
igraph-minus 从图形中删除顶点或边
igraph-vs-attributes 查询或设置顶点序列中顶点的属性
igraph-vs-indexing 索引顶点序列
igraph-vs-indexing2 选择顶点并显示其元数据
igraph.arpack.default ARPACK 特征向量计算
igraph.console igraph 控制台
igraph.drl.coarsen DrL 图布局生成器
igraph.drl.coarsest DrL 图布局生成器
igraph.drl.default DrL 图布局生成器
igraph.drl.final DrL 图布局生成器
igraph.drl.refine DrL 图布局生成器
igraph.eigen.default 图形邻接矩阵的特征值和特征向量
igraph.from.graphNEL 将 graph 包中的 graphNEL 对象转换为 igraph
igraph.options igraph 包的参数
igraph.plotting 绘制图形
igraph.sample 采样随机整数序列
igraph.shape.noclip 绘制 igraph 图时的各种顶点形状
igraph.shape.noplot 绘制 igraph 图时的各种顶点形状
igraph.to.graphNEL 将 igraph 图转换为 graph 包中的 graphNEL 对象
igraph.version 查询 igraph 的版本字符串
igraph.vertex.shapes 绘制 igraph 图时的各种顶点形状
igraphdemo 逐步运行 igraph 演示
igraphtest 运行包测试
igraph_demo 逐步运行 igraph 演示
igraph_opt igraph 包的参数
igraph_options igraph 包的参数
igraph_test 运行包测试
igraph_version 查询 igraph 的版本字符串
incident 图形中顶点的入射边
incident_edges 图形中多个顶点的入射边
indent_print 缩进打印输出
independence.number 独立顶点集
independent.vertex.sets 独立顶点集
induced.subgraph 图形的子图
induced_subgraph 图形的子图
infomap.community Infomap 社区查找
interconnected.islands.game 具有子图的图形,每个子图都是一个随机图。
intersection 两个或多个集合的交集
intersection.igraph 图形的交集
intersection.igraph.es 边序列的交集
intersection.igraph.vs 顶点序列的交集
in_circle 顶点位于圆上的图形布局。
is.bipartite 创建二分图
is.chordal 图形的弦性
is.connected 图的连通分量
is.dag 有向无环图
is.degree.sequence 检查度序列对于多重图是否有效
is.directed 检查图形是否有向
is.graphical.degree.sequence 度序列是否图形化?
is.hierarchical 处理网络社区检测结果的函数
is.igraph 此对象是否为 igraph 图?
is.loop 在图中查找多个或循环边
is.matching 图形匹配
is.maximal.matching 图形匹配
is.minimal.separator 最小顶点分隔符
is.multiple 在图中查找多个或循环边
is.mutual 在有向图中查找互边
is.named 命名图
is.separator 顶点分隔符
is.simple 简单图
is.weighted 加权图
isomorphic 确定两个图形是否同构
isomorphisms 计算两个图形顶点之间的所有同构映射
isomorphism_class 图形的同构类
is_bipartite 创建二分图
is_chordal 图形的弦性
is_connected 图的连通分量
is_dag 有向无环图
is_degseq 检查度序列对于多重图是否有效
is_directed 检查图形是否有向
is_graphical 度序列是否图形化?
is_hierarchical 处理网络社区检测结果的函数
is_igraph 此对象是否为 igraph 图?
is_isomorphic_to 确定两个图形是否同构
is_matching 图形匹配
is_max_matching 图形匹配
is_min_separator 最小顶点分隔符
is_named 命名图
is_printer_callback 这是一个打印机回调吗?
is_separator 顶点分隔符
is_simple 简单图
is_subgraph_isomorphic_to 确定图形是否与另一个图形子图同构
is_tree 确定图形是否为树。
is_weighted 加权图
ivs 独立顶点集
ivs_size 独立顶点集

-- K --

k.regular.game 创建随机规则图形
kautz_graph Kautz 图
keeping_degseq 在保持度分布的同时重新连接图形
knn 平均最近邻居度

-- L --

label.propagation.community 基于传播标签查找社区
laplacian_matrix 图形拉普拉斯算子
largest.cliques 查找派系的函数,即图形中的完整子图
largest.independent.vertex.sets 独立顶点集
largest_cliques 查找派系的函数,即图形中的完整子图
largest_ivs 独立顶点集
largest_weighted_cliques 查找加权派系的函数,即图中的加权完整子图
lastcit.game 随机引用图
last_cit 随机引用图
lattice 创建网格图
layout 图形布局
layout.auto 自动选择适当的图形布局算法
layout.bipartite 二分图的简单两行布局
layout.circle 已弃用的布局函数
layout.davidson.harel Davidson-Harel 布局算法
layout.drl DrL 图布局生成器
layout.fruchterman.reingold 已弃用的布局函数
layout.fruchterman.reingold.grid 网格 Fruchterman-Reingold 布局,已从 igraph 中删除
layout.gem GEM 布局算法
layout.graphopt graphopt 布局算法
layout.grid 简单网格布局
layout.grid.3d 简单网格布局
layout.kamada.kawai 已弃用的布局函数
layout.lgl 已弃用的布局函数
layout.mds 通过多维缩放实现的图形布局
layout.merge 合并图形布局
layout.norm 标准化坐标以绘制图形
layout.random 已弃用的布局函数
layout.reingold.tilford 已弃用的布局函数
layout.sphere 已弃用的布局函数
layout.spring 弹簧布局,已从 igraph 中删除
layout.star 生成坐标以将图的顶点放置为星形
layout.sugiyama Sugiyama 图形布局生成器
layout.svd SVD 布局,已从 igraph 中删除
layout_ 图形布局
layout_as_bipartite 二分图的简单两行布局
layout_as_star 生成坐标以将图的顶点放置为星形
layout_as_tree Reingold-Tilford 图布局算法
layout_components 合并图形布局
layout_in_circle 顶点位于圆上的图形布局。
layout_nicely 自动选择适当的图形布局算法
layout_on_grid 简单网格布局
layout_on_sphere 顶点位于球面上的图形布局
layout_randomly 在平面或 3D 空间中随机放置顶点
layout_with_dh Davidson-Harel 布局算法
layout_with_drl DrL 图布局生成器
layout_with_fr Fruchterman-Reingold 布局算法
layout_with_gem GEM 布局算法
layout_with_graphopt graphopt 布局算法
layout_with_kk Kamada-Kawai 布局算法
layout_with_lgl 大型图形布局
layout_with_mds 通过多维缩放实现的图形布局
layout_with_sugiyama Sugiyama 图形布局生成器
leading.eigenvector.community 基于社区矩阵的引导特征向量检测社区结构
length.cohesiveBlocks 计算内聚块
length.communities 处理网络社区检测结果的函数
LGL 读取外来文件格式
line.graph 图形的线图
line_graph 图形的线图
list.edge.attributes 列出边属性的名称
list.graph.attributes 列出图形属性的名称
list.vertex.attributes 列出顶点属性的名称
local_efficiency 图的效率
local_scan 在图形上计算局部扫描统计信息

-- M --

make_ 创建新图形
make_bipartite_graph 创建二分图
make_chordal_ring 创建扩展的弦环图
make_clusters 创建社区对象。
make_de_bruijn_graph 德布鲁因图
make_directed_graph 从边列表或著名图创建 igraph 图
make_ego_graph 图顶点的邻域
make_empty_graph 没有边的图
make_from_prufer 从 Prufer 序列创建无向树图
make_full_bipartite_graph 创建完整的二分图
make_full_citation_graph 创建完整的(完整)引用图
make_full_graph 创建完整图形
make_graph 从边列表或著名图创建 igraph 图
make_kautz_graph Kautz 图
make_lattice 创建网格图
make_line_graph 图形的线图
make_ring 创建环图
make_star 创建星图,即具有 n 个顶点和 n - 1 个叶子的树
make_tree 创建树图
make_undirected_graph 从边列表或著名图创建 igraph 图
match_vertices 给定顶点对应关系的种子,匹配图形
maxcohesion 计算内聚块
maximal.cliques 查找派系的函数,即图形中的完整子图
maximal.cliques.count 查找派系的函数,即图形中的完整子图
maximal.independent.vertex.sets 独立顶点集
maximal_ivs 独立顶点集
maximum.bipartite.matching 图形匹配
maximum.cardinality.search 最大基数搜索
max_bipartite_match 图形匹配
max_cardinality 最大基数搜索
max_cliques 查找派系的函数,即图形中的完整子图
max_cohesion 计算内聚块
max_flow 图中的最大流量
max_weighted_cliques 查找加权派系的函数,即图中的加权完整子图
mean_distance 顶点之间的最短(有向或无向)路径
median.sir 图形上的 SIR 模型
membership 处理网络社区检测结果的函数
merges 处理网络社区检测结果的函数
merge_coords 合并图形布局
minimal.st.separators 最小尺寸顶点分隔符
minimum.size.separators 最小尺寸顶点分隔符
minimum.spanning.tree 最小生成树
min_cut 图中的最小割
min_separators 最小尺寸顶点分隔符
min_st_separators 最小尺寸顶点分隔符
mod.matrix 图形社区结构的模块化
modularity 图形社区结构的模块化
modularity.communities 处理网络社区检测结果的函数
modularity.igraph 图形社区结构的模块化
modularity_matrix 图形社区结构的模块化
motifs 图模体
mst 最小生成树
multilevel.community 通过模块化的多层优化查找社区结构

-- N --

neighborhood 图顶点的邻域
neighborhood.size 图顶点的邻域
neighbors 图形中的相邻(相邻)顶点
nexus 从 Nexus 网络存储库查询和下载
nexus.get 从 Nexus 网络存储库查询和下载
nexus.info 从 Nexus 网络存储库查询和下载
nexus.list 从 Nexus 网络存储库查询和下载
nexus.search 从 Nexus 网络存储库查询和下载
nexusDatasetInfo 从 Nexus 网络存储库查询和下载
nexus_get 从 Nexus 网络存储库查询和下载
nexus_info 从 Nexus 网络存储库查询和下载
nexus_list 从 Nexus 网络存储库查询和下载
nexus_search 从 Nexus 网络存储库查询和下载
nicely 自动选择适当的图形布局算法
no.clusters 图的连通分量
normalize 标准化布局
norm_coords 标准化坐标以绘制图形

-- O --

on_grid 简单网格布局
on_sphere 顶点位于球面上的图形布局
optimal.community 最佳社区结构

-- P --

pa 使用优先连接生成随机图
page.rank Page Rank 算法
page_rank Page Rank 算法
Pajek 读取外来文件格式
parent 计算内聚块
path 用于沿路径添加或删除边的辅助函数
path.length.hist 顶点之间的最短(有向或无向)路径
pa_age 生成具有优先连接和老化功能的演化随机图
permute 排列图形的顶点
permute.vertices 排列图形的顶点
piecewise.layout 合并图形布局
plot.cohesiveBlocks 计算内聚块
plot.communities 处理网络社区检测结果的函数
plot.graph 图形绘制
plot.igraph 图形绘制
plot.sir 绘制多个 SIR 模型运行的结果
plotHierarchy 计算内聚块
plot_dendrogram 社区结构树状图
plot_dendrogram.communities 社区结构树状图
plot_dendrogram.igraphHRG HRG 树状图
plot_hierarchy 计算内聚块
power.law.fit 将幂律分布函数拟合到离散数据
power_centrality 查找网络位置的 Bonacich 权力中心性分数
predict_edges 基于分层随机图模型预测边
pref 基于特征的随机生成
preference.game 基于特征的随机生成
print.cohesiveBlocks 计算内聚块
print.communities 处理网络社区检测结果的函数
print.igraph 将图形打印到终端
print.igraph.es 将边序列打印到屏幕
print.igraph.vs 在屏幕上显示顶点序列
print.igraphHRG 将分层随机图模型打印到屏幕
print.igraphHRGConsensus 将分层随机图共识树打印到屏幕
print.igraph_layout_modifier 图形布局
print.igraph_layout_spec 图形布局
print.nexusDatasetInfo 从 Nexus 网络存储库查询和下载
print.nexusDatasetInfoList 从 Nexus 网络存储库查询和下载
printer_callback 创建打印机回调函数
printr 更好地打印 R 包
print_all 将图形打印到终端

-- Q --

quantile.sir 图形上的 SIR 模型

-- R --

radius 图形的半径
random.graph.game 根据 Erdos-Renyi 模型生成随机图
randomly 在平面或 3D 空间中随机放置顶点
random_edge_walk 图形上的随机游走
random_walk 图形上的随机游走
read.graph 读取外来文件格式
read_graph 读取外来文件格式
realize_degseq 从给定的度序列创建图形,确定性
reciprocity 图形的互易性
remove.edge.attribute 删除边属性
remove.graph.attribute 删除图形属性
remove.vertex.attribute 删除顶点属性
rep.igraph 多次复制图形
rev.igraph.es 反转边序列中的顺序
rev.igraph.vs 反转顶点序列中的顺序
reverse_edges 反转图形中的边
rewire 重新连接图形的边
rglplot 使用 OpenGL 进行图形的 3D 绘图
rglplot.igraph 使用 OpenGL 进行图形的 3D 绘图
ring 创建环图
running.mean 时间序列的运行平均值
running_mean 时间序列的运行平均值
r_pal 默认 R 调色板

-- S --

sample_ 从随机图形模型中采样
sample_asym_pref 基于特征的随机生成
sample_bipartite 二分随机图
sample_cit_cit_types 随机引用图
sample_cit_types 随机引用图
sample_correlated_gnp 通过随机添加/删除边从给定的图形生成新的随机图形
sample_correlated_gnp_pair 采样一对相关的 G(n,p) 随机图形
sample_degseq 生成具有给定度序列的随机图
sample_dirichlet 从 Dirichlet 分布采样
sample_dot_product 根据随机点积图模型生成随机图
sample_fitness 来自顶点适应性分数的随机图形
sample_fitness_pl 来自顶点适应性分数的无标度随机图形
sample_forestfire 森林火灾网络模型
sample_gnm 根据 G(n,m) Erdos-Renyi 模型生成随机图
sample_gnp 根据 G(n,p) Erdos-Renyi 模型生成随机图
sample_grg 几何随机图
sample_growing 增长随机图生成
sample_hierarchical_sbm 采样分层随机块模型
sample_hrg 从分层随机图模型采样
sample_islands 具有子图的图形,每个子图都是一个随机图。
sample_k_regular 创建随机规则图形
sample_last_cit 随机引用图
sample_motifs 图模体
sample_pa 使用优先连接生成随机图
sample_pa_age 生成具有优先连接和老化功能的演化随机图
sample_pref 基于特征的随机生成
sample_sbm 采样随机块模型
sample_seq 采样随机整数序列
sample_smallworld Watts-Strogatz 小世界模型
sample_spanning_tree 从图形的生成树中随机均匀地采样
sample_sphere_surface 从球面表面均匀地采样向量
sample_sphere_volume 从球体体积均匀地采样向量
sample_traits 基于不同顶点类型生成图
sample_traits_callaway 基于不同顶点类型生成图
sample_tree 随机均匀地采样树
sbm 采样随机块模型
sbm.game 采样随机块模型
scan_stat 在图形时间序列上扫描统计信息
scg 矩阵和图形 SCG 的一体化函数
scg-method 谱粗粒化
scgGrouping SCG 问题求解器
scgNormEps 谱粗粒化 (SCG) 近似的误差
scgSemiProjectors 半投影器
scg_eps 谱粗粒化 (SCG) 近似的误差
scg_group SCG 问题求解器
scg_semi_proj 半投影器
seeded.graph.match 给定顶点对应关系的种子,匹配图形
sequential_pal 顺序调色板
set.edge.attribute 设置边属性
set.graph.attribute 设置图形属性
set.vertex.attribute 设置顶点属性
set_edge_attr 设置边属性
set_graph_attr 设置图形属性
set_vertex_attr 设置顶点属性
shapes 绘制 igraph 图时的各种顶点形状
shape_noclip 绘制 igraph 图时的各种顶点形状
shape_noplot 绘制 igraph 图时的各种顶点形状
shortest.paths 顶点之间的最短(有向或无向)路径
shortest_paths 顶点之间的最短(有向或无向)路径
showtrace 处理网络社区检测结果的函数
show_trace 处理网络社区检测结果的函数
similarity 两个顶点的相似度度量
similarity.dice 两个顶点的相似度度量
similarity.invlogweighted 两个顶点的相似度度量
similarity.jaccard 两个顶点的相似度度量
simplified Constructor modifier to drop multiple and loop edges

构造函数修饰符,用于删除多重边和环边

simplify 简单图
simplify_and_colorize 简单图
sir 图形上的 SIR 模型
sizes 处理网络社区检测结果的函数
smallworld Watts-Strogatz 小世界模型
spectrum 图形邻接矩阵的特征值和特征向量
spinglass.community 基于统计力学在图中查找社区
split_join_distance Split-join distance of two community structures

两个社群结构的分裂-合并距离

srand Deprecated function, used to set random seed of the C library's RNG

已弃用的函数,用于设置 C 库 RNG 的随机种子

star 创建星图,即具有 n 个顶点和 n - 1 个叶子的树
static.fitness.game 来自顶点适应性分数的随机图形
static.power.law.game 来自顶点适应性分数的无标度随机图形
stCuts List all (s,t)-cuts of a graph

列出图的所有 (s,t)-割

stMincuts List all minimum (s,t)-cuts of a graph

列出图的所有最小 (s,t)-割

stochastic_matrix 图的随机矩阵
str.igraph 将图形打印到终端
strength 强度或加权顶点度
st_cuts List all (s,t)-cuts of a graph

列出图的所有 (s,t)-割

st_min_cuts List all minimum (s,t)-cuts of a graph

列出图的所有最小 (s,t)-割

subcomponent In- or out- component of a vertex

顶点的入度或出度分量

subgraph 图形的子图
subgraph.centrality Find subgraph centrality scores of network positions

查找网络位置的子图中心性得分

subgraph.edges 图形的子图
subgraph_centrality Find subgraph centrality scores of network positions

查找网络位置的子图中心性得分

subgraph_isomorphic 确定图形是否与另一个图形子图同构
subgraph_isomorphisms 图形与另一个图形子图之间的所有同构映射
summary.cohesiveBlocks 计算内聚块
summary.igraph 将图形打印到终端
summary.nexusDatasetInfoList 从 Nexus 网络存储库查询和下载

-- T --

t.igraph 反转图形中的边
tail_of Tails of the edge(s) in a graph

图中边的尾部

time_bins 图形上的 SIR 模型
time_bins.sir 图形上的 SIR 模型
tkigraph Experimental basic igraph GUI

实验性基本 igraph GUI

tkplot Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tkplot.canvas Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tkplot.center Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tkplot.close Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tkplot.export.postscript Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tkplot.fit.to.screen Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tkplot.getcoords Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tkplot.off Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tkplot.reshape Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tkplot.rotate Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tkplot.setcoords Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tk_canvas Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tk_center Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tk_close Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tk_coords Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tk_fit Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tk_off Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tk_postscript Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tk_reshape Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tk_rotate Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

tk_set_coords Interactive plotting of graphs

图的交互式绘图

topological.sort Topological sorting of vertices in a graph

图中顶点的拓扑排序

topo_sort Topological sorting of vertices in a graph

图中顶点的拓扑排序

to_prufer Convert a tree graph to its Prufer sequence

将树图转换为其 Prufer 序列

traits 基于不同顶点类型生成图
traits_callaway 基于不同顶点类型生成图
transitivity Transitivity of a graph

图的传递性

tree 创建树图
triad.census Triad census, subgraphs with three vertices

三元组普查,具有三个顶点的子图

triad_census Triad census, subgraphs with three vertices

三元组普查,具有三个顶点的子图

triangles 在图中查找三角形

-- U --

UCINET 读取外来文件格式
undirected_graph 从边列表或著名图创建 igraph 图
unfold.tree Convert a general graph into a forest

将一般图转换为森林

unfold_tree Convert a general graph into a forest

将一般图转换为森林

union Union of two or more sets

两个或多个集合的并集

union.igraph 图形的并集
union.igraph.es Union of edge sequences

边序列的并集

union.igraph.vs Union of vertex sequences

顶点序列的并集

unique.igraph.es Remove duplicate edges from an edge sequence

从边序列中删除重复边

unique.igraph.vs Remove duplicate vertices from a vertex sequence

从顶点序列中删除重复顶点

upgrade_graph igraph 数据结构版本

-- V --

V Vertices of a graph

图的顶点

V<- 查询或设置顶点序列中顶点的属性
vcount 图的阶数(顶点数)
vertex Helper function for adding and deleting vertices

用于添加和删除顶点的辅助函数

vertex.attributes 查询图的顶点属性
vertex.attributes<- Set one or more vertex attributes

设置一个或多个顶点属性

vertex.connectivity 顶点连通性。
vertex.disjoint.paths 顶点连通性。
vertex.shape.pie Using pie charts as vertices in graph plots

在图图中将饼图用作顶点

vertex.shapes 绘制 igraph 图时的各种顶点形状
vertex_attr 查询图的顶点属性
vertex_attr<- Set one or more vertex attributes

设置一个或多个顶点属性

vertex_attr_names 列出顶点属性的名称
vertex_connectivity 顶点连通性。
vertex_disjoint_paths 顶点连通性。
vertices Helper function for adding and deleting vertices

用于添加和删除顶点的辅助函数

-- W --

walktrap.community 通过短随机游走实现的社区结构
watts.strogatz.game Watts-Strogatz 小世界模型
weighted_cliques 查找加权派系的函数,即图中的加权完整子图
weighted_clique_num 查找加权派系的函数,即图中的加权完整子图
which_loop 在图中查找多个或循环边
which_multiple 在图中查找多个或循环边
which_mutual 在有向图中查找互边
without_attr Construtor modifier to remove all attributes from a graph

构造函数修饰符,用于从图中删除所有属性

without_loops Constructor modifier to drop loop edges

构造函数修饰符,用于删除环边

without_multiples Constructor modifier to drop multiple edges

构造函数修饰符,用于删除多重边

with_dh Davidson-Harel 布局算法
with_drl DrL 图布局生成器
with_edge_ Constructor modifier to add edge attributes

构造函数修饰符,用于添加边属性

with_fr Fruchterman-Reingold 布局算法
with_gem GEM 布局算法
with_graphopt graphopt 布局算法
with_graph_ Constructor modifier to add graph attributes

构造函数修饰符,用于添加图属性

with_igraph_opt Run code with a temporary igraph options setting

使用临时的 igraph 选项设置运行代码

with_kk Kamada-Kawai 布局算法
with_lgl 大型图形布局
with_mds 通过多维缩放实现的图形布局
with_sugiyama Sugiyama 图形布局生成器
with_vertex_ Constructor modifier to add vertex attributes

构造函数修饰符,用于添加顶点属性

write.graph Writing the graph to a file in some format

以某种格式将图写入文件

write_graph Writing the graph to a file in some format

以某种格式将图写入文件

-- misc --

$.igraph 获取和设置图形属性,快捷方式
$.igraph.es 查询或设置边序列中边的属性
$.igraph.vs 查询或设置顶点序列中顶点的属性
$<-.igraph 获取和设置图形属性,快捷方式
$<-.igraph.es 查询或设置边序列中边的属性
$<-.igraph.vs 查询或设置顶点序列中顶点的属性
%--% 索引边序列
%->% 索引边序列
%<-% 索引边序列
%>% Magrittr's pipes

Magrittr 的管道

%c% 将两个图形组合为二元关系
%du% 图的非交并集
%m% 图的差集
%s% 图形的交集
%u% 图形的并集
*.igraph 多次复制图形
+.igraph Add vertices, edges or another graph to a graph

向图中添加顶点、边或另一个图

-.igraph 从图形中删除顶点或边
.apply_modifiers Applies a set of constructor modifiers to an already constructed graph.

将一组构造函数修饰符应用于已构造的图。

.data “.data”和“.env”代词
.env “.data”和“.env”代词
.extract_constructor_and_modifiers Takes an argument list and extracts the constructor specification and constructor modifiers from it.

获取参数列表,并从中提取构造函数规范和构造函数修饰符。

[.igraph Query and manipulate a graph as it were an adjacency matrix

查询和操作图,就像它是一个邻接矩阵一样

[.igraph.es 索引边序列
[.igraph.vs 索引顶点序列
[.nexusDatasetInfoList 从 Nexus 网络存储库查询和下载
[<-.igraph.es 查询或设置边序列中边的属性
[<-.igraph.vs 查询或设置顶点序列中顶点的属性
[[.igraph Query and manipulate a graph as it were an adjacency list

查询和操作图,就像它是一个邻接表一样

[[.igraph.es 选择边并显示其元数据
[[.igraph.vs 选择顶点并显示其元数据
[[<-.igraph.es 查询或设置边序列中边的属性
[[<-.igraph.vs 查询或设置顶点序列中顶点的属性