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count_subgraph_isomorphisms {igraph}R 文档

计算一个图与另一个图的子图之间的同构映射的数量

描述

计算一个图与另一个图的子图之间的同构映射的数量

用法

count_subgraph_isomorphisms(pattern, target, method = c("lad", "vf2"), ...)

参数

pattern

较小的图,可以是有向图或无向图。无向图被视为具有互逆边的有向图。

目标

较大的图,可以是有向图或无向图。无向图被视为具有互逆边的有向图。

method

使用的方法。可能的值:‘lad’、‘vf2’。请参阅下面的详细信息。

...

传递给各种方法的其他参数。

逻辑标量,如果 patterntarget 的(可能诱导的)子图同构,则为 TRUE

‘lad’ 方法

这是 Solnon 的 LAD 算法,请参阅下面的参考资料。它有以下额外的参数

domains

如果不是 NULL,则指定匹配限制。它必须是一个 target 顶点集的列表,以数字顶点 ID 或符号顶点名称给出。列表的长度必须是 vcount(pattern),并且对于 pattern 中的每个顶点,它都会给出 target 中允许的匹配顶点。默认为 NULL

induced

逻辑标量,是否搜索诱导子图。默认为FALSE

time.limit

计算的处理器时间限制,以秒为单位。默认为Inf,表示没有限制。

‘vf2’ 方法

此方法使用 Cordella、Foggia 等人的 VF2 算法,请参阅下面的参考资料。它支持顶点和边的颜色,并具有以下额外的参数

vertex.color1, vertex.color2

可选的整数向量,给出彩色图同构的顶点颜色。如果未给出,但图具有“color”顶点属性,则将使用它。如果要忽略这些属性,请为这两个参数提供 NULL。另请参见下面的示例。

edge.color1, edge.color2

可选的整数向量,给出边彩色(子)图同构的边颜色。如果未给出,但图具有“color”边属性,则将使用它。如果要忽略这些属性,请为这些参数提供 NULL

参考

LP Cordella, P Foggia, C Sansone, and M Vento: An improved algorithm for matching large graphs, Proc. of the 3rd IAPR TC-15 Workshop on Graphbased Representations in Pattern Recognition, 149–159, 2001.

C. Solnon: AllDifferent-based Filtering for Subgraph Isomorphism, Artificial Intelligence 174(12-13):850–864, 2010.

参见

其他图同构:count_isomorphisms(), graph_from_isomorphism_class(), isomorphic(), isomorphism_class(), isomorphisms(), subgraph_isomorphic(), subgraph_isomorphisms()


[包 igraph 版本 1.3.5 索引]