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plot.sir {igraph}

R 文档

绘制多个 SIR 模型运行的结果

描述

此函数可以方便地绘制多个 SIR 模型模拟的结果。

用法

## S3 method for class 'sir'
plot(
  x,
  comp = c("NI", "NS", "NR"),
  median = TRUE,
  quantiles = c(0.1, 0.9),
  color = NULL,
  median_color = NULL,
  quantile_color = NULL,
  lwd.median = 2,
  lwd.quantile = 2,
  lty.quantile = 3,
  xlim = NULL,
  ylim = NULL,
  xlab = "Time",
  ylab = NULL,
  ...
)

参数

x	SIR 模拟的输出，来自 sir 函数。
comp	字符标量，要绘制的组件。可以是 ‘NI’（感染者，默认值）、‘NS’（易感者）或 ‘NR’（康复者）。
median	逻辑标量，是否绘制（分箱）中位数。
quantiles	要绘制的（分箱）分位数向量。
color	单个模拟曲线的颜色。
median_color	中位数曲线的颜色。
quantile_color	分位数曲线的颜色。（如果需要，它将被循环使用，如果太长，则忽略不需要的条目。）
lwd.median	中位数的线宽。
lwd.quantile	分位数曲线的线宽。
lty.quantile	分位数曲线的线型。
xlim	x 轴限制，一个两元素数值向量。如果 NULL，则从数据计算。
ylim	y 轴限制，一个两元素数值向量。如果 NULL，则从数据计算。
xlab	x 轴标签。
ylab	y 轴标签。如果 NULL，则根据 comp 参数自动添加。
...	附加参数传递给 plot，它在添加任何曲线之前运行，以创建图形。

详细信息

易感/感染/康复个体数量随时间推移的绘制，用于多个模拟。

值

无。

作者

Eric Kolaczyk (http://math.bu.edu/people/kolaczyk/) 和 Gabor Csardi csardi.gabor@gmail.com。

参考

Bailey, Norman T. J. (1975). The mathematical theory of infectious diseases and its applications (2nd ed.). London: Griffin.

参见

sir 用于运行实际模拟。

示例

g <- sample_gnm(100, 100)
sm <- sir(g, beta=5, gamma=1)
plot(sm)

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