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layout_as_bipartite {igraph}

R 文档

用于二分图的简单两行布局

描述

在用于二分图的简单两行（或列）布局中最小化边交叉。

用法

layout_as_bipartite(graph, types = NULL, hgap = 1, vgap = 1, maxiter = 100)

as_bipartite(...)

参数

图	二分输入图。它应该具有逻辑“type”顶点属性，或者必须给出 types 参数。
types	一个逻辑向量，顶点类型。如果此参数为 NULL（默认值），则使用“type”顶点属性。
hgap	实数标量，同一层中顶点之间的最小水平间距。
vgap	实数标量，两层之间的距离。
maxiter	整数标量，交叉最小化阶段的最大迭代次数。100 是一个合理的默认值；如果您觉得边交叉太多，请增加此值。
...	传递给 layout_as_bipartite 的参数。

详细信息

布局的创建方法是，首先根据顶点类型将顶点放置在两行中。然后，使用 Sugiyama 算法（参见 layout_with_sugiyama）优化行内的位置，以最小化边交叉。

值

一个矩阵，包含两列，行数与输入图中的顶点数相同。

作者

Gabor Csardi csardi.gabor@gmail.com

参见

layout_with_sugiyama

其他图布局：add_layout_()、component_wise()、layout_as_star()、layout_as_tree()、layout_in_circle()、layout_nicely()、layout_on_grid()、layout_on_sphere()、layout_randomly()、layout_with_dh()、layout_with_fr()、layout_with_gem()、layout_with_graphopt()、layout_with_kk()、layout_with_lgl()、layout_with_mds()、layout_with_sugiyama()、layout_()、merge_coords()、norm_coords()、normalize()

示例

# Random bipartite graph
inc <- matrix(sample(0:1, 50, replace = TRUE, prob=c(2,1)), 10, 5)
g <- graph_from_incidence_matrix(inc)
plot(g, layout = layout_as_bipartite,
     vertex.color=c("green","cyan")[V(g)$type+1])

# Two columns
g %>%
  add_layout_(as_bipartite()) %>%
  plot()

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