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layout_with_gem {igraph}

R 文档

GEM 布局算法

描述

使用 GEM 力导向布局算法在平面上放置顶点。

用法

layout_with_gem(
  graph,
  coords = NULL,
  maxiter = 40 * vcount(graph)^2,
  temp.max = max(vcount(graph), 1),
  temp.min = 1/10,
  temp.init = sqrt(max(vcount(graph), 1))
)

with_gem(...)

参数

图	输入图。边方向将被忽略。
coords	如果不是 NULL，则起始坐标应在此处给出，以两列或三列矩阵的形式，具体取决于 dim 参数。
maxiter	要执行的最大迭代次数。更新单个顶点计为一次迭代。合理的默认值是 40 * n * n，其中 n 是顶点数。原始论文建议 4 * n * n，但这通常仅在仔细设置其他参数时才有效。
temp.max	允许的最大局部温度。合理的默认值是顶点数。
temp.min	算法终止时的全局温度（即使在达到 maxiter 迭代之前）。合理的默认值为 1/10。
temp.init	所有顶点的初始局部温度。合理的默认值是顶点数的平方根。
...	传递给 layout_with_gem。

详细信息

有关该算法的详细信息，请参阅下面引用的论文。

值

一个数值矩阵，具有两列，行数与顶点数相同。

作者

Gabor Csardi csardi.gabor@gmail.com

参考

Arne Frick, Andreas Ludwig, Heiko Mehldau: 一种用于无向图的快速自适应布局算法, Proc. Graph Drawing 1994, LNCS 894, pp. 388-403, 1995.

参见

layout_with_fr, plot.igraph, tkplot

其他图布局：add_layout_(), component_wise(), layout_as_bipartite(), layout_as_star(), layout_as_tree(), layout_in_circle(), layout_nicely(), layout_on_grid(), layout_on_sphere(), layout_randomly(), layout_with_dh(), layout_with_fr(), layout_with_graphopt(), layout_with_kk(), layout_with_lgl(), layout_with_mds(), layout_with_sugiyama(), layout_(), merge_coords(), norm_coords(), normalize()

示例

set.seed(42)
g <- make_ring(10)
plot(g, layout=layout_with_gem)

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