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layout_nicely {igraph}

R 文档

自动选择合适的图形布局算法

描述

此函数尝试基于一个简单的算法自动为图形选择合适的图形布局算法。详见下文。

用法

layout_nicely(graph, dim = 2, ...)

nicely(...)

参数

图	输入图
dim	维度，应为 2 或 3。
...	对于 layout_nicely，额外的参数会传递给实际的布局函数。对于 nicely，所有参数都会传递给 layout_nicely。

详细信息

layout_nicely 尝试为提供的图形选择合适的布局函数，并使用它来生成布局。当前实现方式如下

1. 如果图形具有名为“layout”的图形属性，则使用此属性。如果此属性是一个 R 函数，则调用该函数，并传入图形和任何其他额外参数。

2. 否则，如果图形具有名为“x”和“y”的顶点属性，则将它们用作坐标。如果图形还有额外的“z”顶点属性，也会使用它。

3. 否则，如果图形已连接且顶点数少于 1000 个，则通过调用 layout_with_fr 使用 Fruchterman-Reingold 布局。

4. 否则，使用 DrL 布局，并调用 layout_with_drl。

在布局算法实现中，名为“weights”的参数通常用于指定边的权重（如果布局算法支持权重）。在这种情况下，省略“weights”或将其设置为 NULL 将使 igraph 使用图形中的“weight”边属性（如果存在）。但是，大多数布局算法不支持非正权重，因此如果您在未指定显式权重的情况下简单地在图形上调用 layout_nicely，并且权重恰好包含非正数，则 layout_nicely 将会失败。我们努力确保 layout_nicely 可以开箱即用地适用于大多数图形，因此规则是，如果您省略“weights”或将其设置为 NULL 并且 layout_nicely 最终会调用 layout_with_fr 或 layout_with_drl，我们不会将权重转发给这些函数，并发出有关此的警告。您可以使用 weights = NA 来消除警告。

值

一个数值矩阵，具有两列或三列。

作者

Gabor Csardi csardi.gabor@gmail.com

参见

plot.igraph

其他图形布局：add_layout_(), component_wise(), layout_as_bipartite(), layout_as_star(), layout_as_tree(), layout_in_circle(), layout_on_grid(), layout_on_sphere(), layout_randomly(), layout_with_dh(), layout_with_fr(), layout_with_gem(), layout_with_graphopt(), layout_with_kk(), layout_with_lgl(), layout_with_mds(), layout_with_sugiyama(), layout_(), merge_coords(), norm_coords(), normalize()

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